新生児病棟は、人工換気等による集中治療を行うNICU9床と、中等症児およびNICUから移行した児を対象とするGCU12床からなっています。

早産・低出生体重児および合併症をもつ新生児を治療、養育します。なお、秋田県周産期医療の役割分担により、先天異常の胎児・新生児と新生児外科疾患および先天性心疾患合併の胎児・新生児については主に秋田大学医学部附属病院NICU、GCUが担当しています。

周産期医療のネットワークと地域化による重症児の集中化で、母体搬送→院内出生→NICU入院という流れで、より望ましい形の周産期医療を実践しています。新生児搬送での入院も受け入れています。秋田県で出生した超低出生体重児の90−100％を扱っています。

新生児救急に24時間体制で対応するために、5人の新生児専任医師で当直体制を組んでいます。看護師は、NICU3人とGCU2人で夜勤をしています。

また、入院中だけでなく退院後も母子とその家族を支援するために、院内の各外来および地域と連携して、児の成長、発達のフォローをしています。